《中文核心期刊要目总览》编委会依据文献计量学原理和方法，经研究人员对相关文献的检索、计算和分析，并通过学科专家评审，《热带亚热带植物学报》被确定为植物学类的核心期刊，并被编入《中文核心期刊要目总览》2004年版（第四版）。该书定于2004年7月由北京大学出版社出版。
    该版核心期刊的评选，采用了被索量、被摘量、被引量、它引量、被摘率、影响因子、获国家奖或被国内外重要检索工具收录等7个评价指标，经过定量筛选和专家定性评审，从我国正在出版的近1万2千种中文期刊中评选出1800种核心期刊。
    《热带亚热带植物学报》再次被确定为核心期刊，是在华南植物园历届领导和编委们的大力支持在下，在广大作者、读者和编辑们的努力下取得的。