2005年
1月6日: 由周国逸研究员主持的国家基础研究重大项目前期研究专项“地形抬升与海陆分布对生态系统形成及某些功能的影响机制研究”通过国家科技部组织的结题验收。
1月17日: 华南植物园成立新一届学术委员会。主任：周国逸；副主任：叶万辉、张奠湘、魏孝义；委员：夏念和、张奠湘、葛学军、郝刚、邢福武、廖景平、傅声雷、赵平、李志安、莫江明、任海、周国逸、叶万辉、黄忠良、蒋跃明、魏孝义、段俊、吴国江、傅德志、彭少麟、黄宏文、康乐、邬建国、施苏华、骆世明、王绍增、田长恩。秘书：科研处处长。
1月23-28日: 澳大利亚园艺专家Ben Wallace博士、景观设计师Geoffrey Britton访问华南植物园。中澳方专家研究确定了华南植物园澳大利亚植物专类园的建设、设计进程、工作框架及指导机制等事宜。
2月3日: 华南植物园任命：张德强任鼎湖山森林生态系统定位研究站副站长；林永标任鹤山丘陵综合实验站副站长；李志安任小良生态系统定位研究站副站长；申卫军任广东省数字植物园重点实验室常务副主任。
2月5日-3月5日: 华南植物园举办“人与自然摄影大赛”。
2月13日: 华南植物园举办“精品国兰展”。
2月18日: 中科院党组成员、中纪委驻中科院纪检组长王庭大，中科院监察审计局局长彭玉水等到华南植物园视察。
2月21日: 穗科院人〔2005〕7号文：任命魏平任华南植物园副主任（任期至本届班子期满）。
3月7日: 华南植物园调整组织结构，实施模块管理：调整后的四大模块由党群部、行管总部、研究院、管理公司组成；行管总部下设教学部、科研部、人力资源部、资产部、经济部、合作部、科普部、园艺部、保护区管理局。
3月15日: 华南植物园任命：谢燕辉、蚁伟民任主任助理；王远球任主任助理兼合作部部长；周国逸任研究院院长（兼）；郑祥慈任科研部部长；赖志敏任教学部部长；魏平任行政总部部长（兼）；陈淑君任行政总部副部长兼综合办公室主任；龚晓萍任资产部部长；黄宁清任经济部部长；黄向力任园艺部部长；廖景平任科普部部长；陈金婷任人力资源部部长；任海任党群部部长（兼）；范德权任党群部副部长；周国逸任鼎湖山国家级自然保护区管理局局长（鼎湖山树木园主任）（兼）；黄忠良、莫江明任鼎湖山国家级自然保护区管理局副局长（鼎湖山树木园副主任）。
3月17日: 园党委副书记任海当选为新一届两院直属机关党委委员。
3月18日: 陈勇主任、周国逸副主任和邢福武研究员出席在澳门民政总署总部举行的《澳门植物名录》发行仪式。
3月25日: 华南植物园调整研究生招生工作领导小组。组长：周国逸；成员：任海、郑祥慈、赖志敏、叶万辉、夏念和、张奠湘、蒋跃明、段俊、魏孝义、赵平、莫江明、郝刚、吴国江、傅声雷。
3月29日: 广州市常务副市长沈伯年在华南植物园主持召开共建领导小组第三次会议。
3月31日: 华南植物园培育的超甜玉米新组合“南甜3号”通过了广东省农作物品种审定委员会审定。
4月1日: 华南植物园成立ARP项目领导小组。组长：陈勇；副组长：魏平、陈淑君、蚁伟民；成员：张征、郑祥慈、龚晓萍、黄宁清、赖志敏、陈金婷、谭辉同。
4月16日: 华南植物园被广州市青少年科技教育协会评为“2003―2004年度广州市科技教育活动先进集体”。
4月18-22日: 华南植物园公共实验室与徕卡仪器有限公司合作举办“全国冷冻超薄片及胶体金免疫标记培训班”。
4月21日: 园党政联席会议研究决定：任命陈海山为华南植物园管理公司（暂名）总经理；免去陈国仆华南植物园管理公司（暂名）总经理职务，改任华南植物园管理公司（暂名）副总经理。
5月12日: 华南植物园入选第二批“全国青少年走进科学世界科技活动示范基地”。
5月13日: 华南植物园共建项目环境影响报告书通过国家环保局审查。
5月16日: 华南植物园举办“2006年琪林社区科普培训暨广东省科普教育基地系列科普活动启动仪式”。
5月17日: 华南植物园举办“2005年全国科技活动周暨广东省科技活动月”启动仪式。
5月24日: 华南植物园成立6个园下属非法人研究所，聘任：赵平任生态研究所所长；张奠湘任系统与进化研究所所长；吴国江任生物技术研究所所长；邢福武任园林与景观研究所所长；廖景平任珍稀濒危植物研究所所长；夏念和任经济植物研究所所长。
5月25日: 中科院副院长李静海在高技术研究与发展局副局长秦伟、广州分院院长/华南植物园园主任陈勇的陪同下视察华南植物园。
6月9日: 中国工程院院士、中国农业专家咨询团主任卢良恕考察华南植物园。
6月21日: 中科院院地合作委员会副主任竺玄到华南植物园调研。
7月1-3日: 由华南植物园、广州市科学技术协会、中华海外生态学者联合会、国家自然科学基金委员会生命科学部、中国生态系统研究网络、南京大学国际地球系统科学研究所、北美生态学会亚洲分会等单位共同主办的“生态系统碳平衡研究理论和方法国际学术研讨会”在广州举行。
7月4-18日: 华南植物园举办“天河科技之夏”夏令营活动。
7月8日: 华南植物园任命：叶万辉研究员任华南植物园研究院常务副院长。
7月18日: 广东省人大常委会副主任王宁生视察华南植物园。
7月19日: 中科院党组副书记方新视察华南植物园。
7月20日: 国家基金委副主任、中科院上海分院院长沈文庆院士，武汉分院院长叶朝辉院士考察华南植物园。
7月20-25日: 任海博士当选中华全国青年联合会第十届委员会委员，并出席全国青联大会。
7月25日: 中国科协主席、中科院院士周光召视察华南植物园。
7月: 华南植物园团委被省直机关团工委授予“省直五四红旗团委”称号。
8月9日: 全国人大副委员长、中科院院长路甬祥视察华南植物园并主持园水系及灌溉系统工程供水启动仪式。
8月13日: 中科院副院长陈竺视察华南植物园并就对园学科发展、科学管理、人才引进工作做重要指示。
8月20日: 国务院参事、第三世界科学院院士、全国政协委员牛文元考察华南植物园。
8月26日: 华南植物园举办“华南植物园2005科普论坛暨夏季科普培训班”。
9月14日: 中科院第十三届分院院长书记联席会议在华南植物园召开。
9月17日: 华南植物园启动“2049行动计划”，迎接全国科普日，同时成立资深科学家科普报告团和研究生科普志愿者队伍。
9月21日:中科院党风廉政建设考评组在广州分院副院长、纪检组组长郭俊的陪同下，对华南植物园党风廉政建设进行考核评估。
10月17日: 澳大利亚花园城市设计公司的Kim Morris和Andrew Prowse应邀访问华南植物园并举办园林建筑讲座。
10月25日: 华南植物园植物科普网站建成开通。
10月26日: 中国科协副主席、中科院院士、第三世界科学院院士赵忠贤视察华南植物园。
10月31日: 中科院党组成员、中国科大党委书记郭传杰考察华南植物园。
10月31日: 华南植物园被中国野生植物保护协会确认为首批“全国野生植物保护科普教育基地”。
10月: 华南植物园被国家体育总局授予“全国群众体育先进单位”光荣称号。
11月6-8日: 由华南植物园和广东省植物学会主办，中山市科学技术协会和中山市药学会承办的“国际菊科艾蒿类植物学术研讨会–系统分类、资源与经济利用”在广东省中山市召开。
11月8日: 中纪委常委、监察部副部长黄树贤视察华南植物园。
11月20日: 华南植物园与广东升威实业有限公司合作组建的广州升华农业工程技术中心签字及揭牌仪式在广州举行。中国科学院副院长陈竺、广州市市委副书记方旋分别致辞并为中心揭牌；广州分院院长/华南植物园主任陈勇和升威公司董事长何泽明分别代表华南植物园和升威公司在合作协议上签字。
11月21日: 由中科院副院长陈竺率领的中科院三期创新考核评估组对华南植物园进行现场考评。
11月: 段俊研究员负责的植物种质创新研究组利用转基因技术成功培育出抗除草剂的转bar基因水稻和抗衰老的转PSAG12-ipt基因水稻。
11月: 蒋跃明研究员应邀担任《Journal of Applied Horticulture》杂志编委。
12月5日: 院省市三方共建华南植物园领导小组第四次会议在华南植物园召开，会议由广东省政府副秘书长江海燕主持。会议就展览温室植物配置经费、共建项目用地规划审批及施工许可证审批、共建项目建设周期延长、广州第一村工地内龙洞村太公坟的迁移补偿费、华南植物园所在地兴科路延长线的实施、周边建筑物的控高、华南植物园水库森林树种更新等问题进行讨论研究，并提出了相关解决方案。
12月6日: 华南植物园被中共广州市委宣传部认定为广州市爱国主义教育示范基地。
12月20日: 英国驻广州领事馆领事Nigel Birch和科技主任Adee Zai 等访问华南植物园。
12月21日: 鹤山丘陵综合开放试验站获批为国家野外科学观测研究站，并命名为“广东鹤山森林生态系统国家野外科学观测站”。
12月: 段俊研究员负责培育的蝴蝶兰与香兰杂交种(Haraenopsis Nanzhi Pink) 成功进行国际登录，被英国皇家园艺协会（RHS）接受为新杂交属，这是我国大陆兰花育种者在RHS上成功登录的第一个新杂交属，也是第一个蝴蝶兰与香兰杂交成功的例子。
12月: 两名外籍博士后Amitosh Verma博士和Merajuddin Khan博士相继进入华南植物园生物学博士后流动站开展科研工作。
12月: 华南植物园被中国科学技术协会评为“全国科普日活动先进单位”。
12月:华南植物园工会被中共广东省直属机关工会工作委员会授予“先进职工之家”。