科研进展

华南植物园在象腿蕉染色体级别基因组组装研究获新进展

发布日期:2022.05.12 作者:scbg

 

  象腿蕉(Ensete glaucum)是芭蕉科中耐寒的蕉类植物,原产于中国云南和东南亚地区,具有重要的观赏、饲用和药用价值。华南植物园海外知名学者John Seymour Heslop Harrison教授领导的研究团队,采用单分子纳米孔、Illumina测序策略,结合染色体构像捕获技术,发表了首个象腿蕉染色体级别的基因组序列,长度为481.5 Mbp,完整性较高(BUSCO 98.3%),注释获得36,836个编码基因,重复序列约占基因组的55%。象腿蕉与芭蕉属(Musa)代表物种的比较基因组学研究发现,象腿蕉的长末端重复序列的组成及其插入时间,与芭蕉科其他物种均有差异,芭蕉属比象腿蕉属有更多Copia象腿蕉LTR插入时间(峰值3.5–5 Mya)比芭蕉属物种(峰值2 Mya)更古老,还发现芭蕉科在911染色体基数进化过程中复杂多样的染色体重组事件。研究结果为蕉类作物保育和改良提供重要的基因组资源。 

  相关研究成果以“A chromosome-level reference genome of Ensete glaucum gives insight into diversity and chromosomal and repetitive sequence evolution in the Musaceae”为题,在基因组领域有影响力的国际杂志Gigascience (IF2020=6.5)上发表。王梓维为该文第一作者,John Seymour Heslop Harrison教授和刘青副研究员为通讯作者,华南植物园葛学军教授和法国农业科学中心Mathieu Rouard教授参与该项工作。本研究得到了华南植物园海外知名学者项目、国家自然科学基金、广东省基础与应用基础研究基金的资助。论文链接:https://doi.org/10.1093/gigascience/giac027

 

 


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